Zavala-Páramo, Alfonso Sinuhé;Oyama, Ken;Mendoza, Eduardo;Zavala-Páramo, María Guadalupe;Pollinger, John;Smith, Thomas B.
Genetic variability in captive individuals of the endangered species Tapirus bairdii in Mexico
Revista Mexicana de Biodiversidad
2017
Journal Article
88
2
480-484
Mammal conservation;Genetic variability;Conservation genetics;Perissodactyla;Mitochondrial D-loop;Conservación de mamíferos;Variabilidad genética;Genética de la conservación;Perissodactyla;D-loop mitocondrial
The Baird's tapir (Tapirus bairdii) is the largest terrestrial mammal dwelling in the neotropics and the only native representative of the order Perissodactyla. This species is under a great threat due to the impacts of hunting and habitat loss. Therefore, implementation of conservation strategies, in situ and ex situ, is urgent. However, to improve effectiveness of these strategies knowledge of the species level of genetic variability is needed. We collected samples (hair, feces and blood) from T. bairdii individuals kept in captivity in 4 zoos in Mexico and the field (feces) to extract DNA. We analyzed tapir levels of genetic variability focusing on a 511bp region of the mtDNA D-loop and a set of 6 microsatellite loci. We found a relatively low allelic richness Rs=3.94 but a relatively high frequency of private alleles (6 out of 24) and a variability of mother lines higher than reported in other studies (7 haplotypes with 15 polymorphic sites, Hd=0.846 and Pi=0.0128). Our results suggest that there might be a relatively high genetic diversity in tapir population inhabiting southern Mexico. El tapir centroamericano (Tapirus bairdii) es el mamífero terrestre de mayor talla en el neotrópico y el único representante nativo del orden Perissodactyla. Esta especie se encuentra bajo un fuerte peligro de extinción por la cacería y la destrucción de su hábitat. Resulta urgente la implementación de estrategias de conservación in situ y ex situ de la especie; sin embargo, se requiere contar con información sobre su variabilidad genética. Obtuvimos ADN de T. bairdii a partir de muestras (pelo, excretas y sangre) de individuos en cautiverio en 4 zoológicos de México y excretas recolectadas en el campo. Analizamos los niveles de variabilidad genética en un fragmento de 511 pares de base de la región D-loop del ADN mitocondrial y en microsatélites para 6 loci. Encontramos una riqueza alélica baja (Rs=3.94) pero un número relativamente alto de alelos exclusivos (6 de un total de 24) en microsatélites así como una variabilidad de las líneas maternas más altas que la registrada en otros estudios (7 haplotipos con 15 sitios polimórficos, Hd=0.846 and Pi=0.0128). Esto sugiere la existencia de una diversidad genética relativamente alta en las poblaciones de tapir que habitan en el sureste de México.